Influenza A virus (A/Puerto Rico/8/1934(H1N1)) segment 4, complete sequence

NCBI Reference Sequence: NC_002017.1

FASTA Graphics

Go to:

LOCUS       NC_002017               1778 bp    cRNA    linear   VRL 13-AUG-2018

DEFINITION  Influenza A virus (A/Puerto Rico/8/1934(H1N1)) segment 4, complete

            sequence.

ACCESSION   NC_002017

VERSION     NC_002017.1

DBLINK      BioProject: PRJNA485481

KEYWORDS    RefSeq.

SOURCE      Influenza A virus (A/Puerto Rico/8/1934(H1N1))

  ORGANISM  Influenza A virus (A/Puerto Rico/8/1934(H1N1))

            Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Negarnaviricota;

            Polyploviricotina; Insthoviricetes; Articulavirales;

            Orthomyxoviridae; Alphainfluenzavirus.

REFERENCE   1  (bases 1 to 1778)

  AUTHORS   Winter,G., Fields,S. and Brownlee,G.G.

  TITLE     Nucleotide sequence of the haemagglutinin gene of a human influenza

            virus H1 subtype

  JOURNAL   Nature 292 (5818), 72-75 (1981)

   PUBMED   7278968

REFERENCE   2  (bases 1 to 1778)

  CONSRTM   NCBI Genome Project

  TITLE     Direct Submission

  JOURNAL   Submitted (12-JUN-2000) National Center for Biotechnology

            Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA

COMMENT     REVIEWED REFSEQ: This record has been curated by NCBI staff. The

            reference sequence was derived from V01088.

            COMPLETENESS: full length.

FEATURES             Location/Qualifiers

     source          1..1778

                     /organism="Influenza A virus (A/Puerto Rico/8/1934(H1N1))"

                     /mol_type="viral cRNA"

                     /strain="A/Puerto Rico/8/1934"

                     /serotype="H1N1"

                     /db_xref="taxon:211044"

                     /segment="4"

                     /country="Puerto Rico"

                     /collection_date="1934"

     gene            33..1733

                     /gene="HA"

                     /locus_tag="FLUAVs4gp1"

                     /db_xref="GeneID:956529"

     CDS             33..1733

                     /gene="HA"

                     /locus_tag="FLUAVs4gp1"

                     /function="receptor binding and fusion protein"

                     /codon_start=1

                     /product="haemagglutinin"

                     /protein_id="NP_040980.1"

                     /db_xref="GOA:P03452"

                     /db_xref="UniProtKB/Swiss-Prot:P03452"

                     /db_xref="GeneID:956529"

                     /translation="MKANLLVLLCALAAADADTICIGYHANNSTDTVDTVLEKNVTVT

                     HSVNLLEDSHNGKLCRLKGIAPLQLGKCNIAGWLLGNPECDPLLPVRSWSYIVETPNS

                     ENGICYPGDFIDYEELREQLSSVSSFERFEIFPKESSWPNHNTTKGVTAACSHAGKSS

                     FYRNLLWLTEKEGSYPKLKNSYVNKKGKEVLVLWGIHHPSNSKDQQNIYQNENAYVSV

                     VTSNYNRRFTPEIAERPKVRDQAGRMNYYWTLLKPGDTIIFEANGNLIAPRYAFALSR

                     GFGSGIITSNASMHECNTKCQTPLGAINSSLPFQNIHPVTIGECPKYVRSAKLRMVTG

                     LRNIPSIQSRGLFGAIAGFIEGGWTGMIDGWYGYHHQNEQGSGYAADQKSTQNAINGI

                     TNKVNSVIEKMNIQFTAVGKEFNKLEKRMENLNKKVDDGFLDIWTYNAELLVLLENER

                     TLDFHDSNVKNLYEKVKSQLKNNAKEIGNGCFEFYHKCDNECMESVRNGTYDYPKYSE

                     ESKLNREKVDGVKLESMGIYQILAIYSTVASSLVLLVSLGAISFWMCSNGSLQCRICI

                     "

     sig_peptide     33..83

                     /gene="HA"

                     /locus_tag="FLUAVs4gp1"

     mat_peptide     84..1064

                     /gene="HA"

                     /locus_tag="FLUAVs4gp1"

                     /product="HA1"

                     /protein_id="YP_163735.1"

     mat_peptide     1065..1730

                     /gene="HA"

                     /locus_tag="FLUAVs4gp1"

                     /product="HA2"

                     /protein_id="YP_163736.1"

ORIGIN      

        1 agcaaaagca ggggaaaata aaaacaacca aaatgaaggc aaacctactg gtcctgttat

       61 gtgcacttgc agctgcagat gcagacacaa tatgtatagg ctaccatgcg aacaattcaa

      121 ccgacactgt tgacacagtg ctcgagaaga atgtgacagt gacacactct gttaacctgc

      181 tcgaagacag ccacaacgga aaactatgta gattaaaagg aatagcccca ctacaattgg

      241 ggaaatgtaa catcgccgga tggctcttgg gaaacccaga atgcgaccca ctgcttccag

      301 tgagatcatg gtcctacatt gtagaaacac caaactctga gaatggaata tgttatccag

      361 gagatttcat cgactatgag gagctgaggg agcaattgag ctcagtgtca tcattcgaaa

      421 gattcgaaat atttcccaaa gaaagctcat ggcccaacca caacacaacc aaaggagtaa

      481 cggcagcatg ctcccatgcg gggaaaagca gtttttacag aaatttgcta tggctgacgg

      541 agaaggaggg ctcataccca aagctgaaaa attcttatgt gaacaagaaa gggaaagaag

      601 tccttgtact gtggggtatt catcacccgt ctaacagtaa ggatcaacag aatatctatc

      661 agaatgaaaa tgcttatgtc tctgtagtga cttcaaatta taacaggaga tttaccccgg

      721 aaatagcaga aagacccaaa gtaagagatc aagctgggag gatgaactat tactggacct

      781 tgctaaaacc cggagacaca ataatatttg aggcaaatgg aaatctaata gcaccaaggt

      841 atgctttcgc actgagtaga ggctttgggt ccggcatcat cacctcaaac gcatcaatgc

      901 atgagtgtaa cacgaagtgt caaacacccc tgggagctat aaacagcagt ctccctttcc

      961 agaatataca cccagtcaca ataggagagt gcccaaaata cgtcaggagt gccaaattga

     1021 ggatggttac aggactaagg aacattccgt ccattcaatc cagaggtcta tttggagcca

     1081 ttgccggttt tattgaaggg ggatggactg gaatgataga tggatggtac ggttatcatc

     1141 atcagaatga acagggatca ggctatgcag cggatcaaaa aagcacacaa aatgccatta

     1201 acgggattac aaacaaggtg aactctgtta tcgagaaaat gaacattcaa ttcacagctg

     1261 tgggtaaaga attcaacaaa ttagaaaaaa ggatggaaaa tttaaataaa aaagttgatg

     1321 atggatttct ggacatttgg acatataatg cagaattgtt agttctactg gaaaatgaaa

     1381 ggactctgga tttccatgac tcaaatgtga agaatctgta tgagaaagta aaaagccaat

     1441 taaagaataa tgccaaagaa atcggaaatg gatgttttga gttctaccac aagtgtgaca

     1501 atgaatgcat ggaaagtgta agaaatggga cttatgatta tcccaaatat tcagaagagt

     1561 caaagttgaa cagggaaaag gtagatggag tgaaattgga atcaatgggg atctatcaga

     1621 ttctggcgat ctactcaact gtcgccagtt cactggtgct tttggtctcc ctgggggcaa

     1681 tcagtttctg gatgtgttct aatggatctt tgcagtgcag aatatgcatc tgagattaga

     1741 atttcagaaa tatgaggaaa aacacccttg tttctact

//